Так называемый фильтр АГС направлен на борьбу с сайтами-сателлитами. То есть с сайтами, созданными специально для продажи ссылок, размещения рекламы или как вспомогательные сайты для продвижения других. Иными словами, чтобы ссылками помогать каким-то сайтам продвигаться и повышать их цитируемость.
Предполагаю, что, коммерческий сайт априори не должен попасть под этот фильтр. Потому что очень редко встретишь коммерческую организацию, которая настолько безответственно подходит к своему сайту, что допускает его попадание под АГС.
Тем не менее, такой фильтр есть. И если на вашем сайте все материалы просто сгенерированы роботом, если на нём какое-то нереальное количество страниц, ценность которых нулевая, если на сайте размещены ссылки, то высока вероятность попадания сайт под этот фильтр.